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akoyabio空間分辨,多重免疫熒光的全麵解決方案

 更新時間:2020-10-12 點擊量:3887

Akoya Biosesciences是Akoya Biosesciences,Inc.(一家特拉華州公司)的注冊(ce) 商標,而Spatial Biology Company是Akoya Biosesciences,Inc.的商標。 

akoyabio空間分辨,多重免疫熒光的全麵解決方案

表征組織微環境的複雜性是理解驅動疾病以及治療反應的分子和細胞機製的關(guan) 鍵要素。

浸潤的免疫細胞和細胞基質重塑之間的空間關(guan) 係作用被廣泛認為(wei) 是定義(yi) 組織異質性的關(guan) 鍵成分。CODEX係統使研究人員能夠以單細胞分辨率對組織樣品中的40多種蛋白質標記物成像。高度複用的成像技術可以研究不同的細胞表型,以及它們(men) 如何在原位相互作用以影響疾病的病理和進展。

CODEX Vornoi圖

 

CODEX技術

CODEX(通過indEXing進行共檢測)技術使用與(yu) 專(zhuan) 有Akoya條形碼偶聯的抗體(ti) ,該條形碼由*的寡核苷酸序列組成。CODEX分析法使用染料標記的Reporter靶向特定條形碼,以進行高度特異性的檢測。

用CODEX抗體(ti) 板對組織樣品進行單步染色,然後Reporters通過成像和去除的迭代循環與(yu) 互補條形碼結合。循環由CODEX流體(ti) 力學儀(yi) 器*自動化。

靈活

為(wei) 新鮮的冷凍或FFPE組織設計定製麵板

樣品友好

可以對樣本重新成像以進行感興(xing) 趣區域(ROI)分析

可擴展

以單細胞分辨率在單個(ge) 組織樣本中成像40+個(ge) 標記

全麵

包括試劑和軟件分析套件

CODEX複用成像示例

CODEX解決(jue) 方案與(yu) 許多組織類型和格式兼容。

乳癌組織用36重CODEX麵板染色

 

人類乳腺FFPE組織被36重麵板染色

  • 鈣粘蛋白
  • KRT19
  • KRT17
  • 肌動蛋白
  • Ki67
  • CD31
  • DAPI

用28重CODEX麵板染色的肺癌組織

 

肺癌FFPE組織被28重麵板染色

  • 泛細胞角蛋白
  • CD8
  • Ki67
  • PD-L1
  • PD-1
  • CD68

 

人體(ti) 皮膚新鮮的冷凍組織沾有26層麵板

  • 泛細胞角蛋白
  • CD138
  • CD49f
  • CD45
  • CD34
  • Podoplanin
  • CD31

 

固定人PBMC並用26重麵板染色

  • Ki67
  • CD45
  • CD2
  • CD31
  • CD63
  • CD45
  • CD7

 

腎細胞癌FFPE組織用15重麵板染色

  • Ki67
  • CD8
  • CD4
  • Podoplanin
  • SMA
  • CD20
  • CD31

實驗工作流程

01

弄髒

使用CODEX抗體(ti) 麵板準備和染色組織隻需一步即可,從(cong) 而減少了周轉時間並保持了樣品完整性。

02

圖片

全自動CODEX儀(yi) 器和配套顯微鏡在您的組織中對40多個(ge) 標記圖像進行成像。用戶可以將目標分辨率降至20倍的單細胞分辨率,將目標分辨率降至40倍的亞(ya) 細胞分辨率。

03

分析

使用全麵的CODEX軟件套件處理,分析和可視化圖像。用戶可以訪問可視化工具,如用於(yu) 細胞表型的門控和聚類。用戶還可以導出文件以在第三方軟件中使用。

醫學博士安德拉斯·阿·赫茲(zi) (Andras A Heczey)

丹·L·鄧肯綜合癌症中心兒(er) 科腫瘤學助理教授

貝勒醫學院

輸液後活檢非常珍貴……借助CODEX,我們(men) 的目標是從(cong) 組織的小樣本中獲取多的數據,以盡可能多地了解腫瘤的微環境。

Garry Nolan博士

Rachford和Carlota A. Harris微生物學和免疫學係教授

斯坦福大學,Akoya Biosesciences聯合創始人

CODEX的商業(ye) 發布是我實驗室的一個(ge) 裏程碑,也是生物醫學科學的一個(ge) 令人興(xing) 奮的機會(hui) 。同時經濟地分析完整組織上數十種或更多種蛋白質標記的能力將從(cong) 根本上改變我們(men) 對細胞相互作用和疾病生物學的理解。

實例探究

範德比爾特糖尿病中心的Powers&Brissova研究小組使用CODEX來研究胰島微環境。

 

斯坦福大學的細胞科學成像設施(CSIF)通過CODEX係統上的多重成像項目擴展了其核心實驗室服務。

 

賓夕法尼亞(ya) 大學的研究人員開發了一種方法,可以將單細胞CITE-seq數據映射到CODEX複用IHC圖像,以進行空間單細胞多組學研究。

 

CODEX分析試劑和抗體

CODEX分析法通過迭代成像循環靶向抗體(ti) 組的子集,從(cong) 而克服了傳(chuan) 統的多重免疫熒光技術的挑戰,從(cong) 而在單個(ge) 組織切片中揭示了40多種生物標誌物。

我們(men) 提供了完整的解決(jue) 方案,其中包括針對CODEX係統進行了優(you) 化和驗證的抗體(ti) 和試劑。經驗證和庫存的抗體(ti) 可用於(yu) 不同類型的組織:小鼠新鮮冷凍,人新鮮冷凍和人FFPE。用戶可以使用Akoya的定製偶聯試劑盒靈活地創建由市售的,經Akoya驗證的抗體(ti) 或標有CODEX條形碼的克隆組成的麵板。

試劑盒和試劑

用於(yu) 組織染色,自定義(yi) 綴合和執行CODEX實驗的緩衝(chong) 液和試劑

CODEX抗體(ti)

CODEX共軛抗體(ti) ,用於(yu) 構建抗體(ti) 麵板

CODEX條碼

修飾寡核苷酸,易於(yu) 偶聯定製CODEX抗體(ti)

CODEX記者

熒光團偶聯的寡核苷酸,用於(yu) CODEX抗體(ti) 的可視化

 

試劑盒和試劑

CODEX分析需要專(zhuan) 門配製的試劑和緩衝(chong) 液,以使用CODEX抗體(ti) 對組織染色並進行迭代成像循環。對於(yu) 每個(ge) 成像周期,將三個(ge) 帶有特定光譜染料的CODEX Reporter應用於(yu) 染色的組織,以可視化相應的CODEX抗體(ti) 。該CODEX儀(yi) 器適用輕柔洗滌步驟去除CODEX記者無任何化學修飾,隨後施加下一組記者的想象下一組CODEX抗體(ti) 。

目錄 #

名稱

尺寸

700000110X CODEX緩衝區10個反應
7000002CODEX檢測試劑10個反應
7000003核染色10個反應
7000008CODEX染色套件10個反應
7000009CODEX偶聯試劑盒10個反應
7000010CODEX墊片v210個墊片
232107CODEX存儲緩衝區120毫升
7000005蓋玻片138
700000696孔板10
700000796孔板密封10
7000013CODEX蓋玻片儲物盒1盒

 

CODEX抗體(ti)

CODEX抗體(ti) 是單獨提供的,可以混合使用並與(yu) 設計麵板匹配,以同時分析多達40多種生物標誌物。

Akoya提供經過充分測試的CODEX抗體(ti) 和一係列補充抗體(ti) 。

 

CODEX ®盤點抗體(ti)

CODEX清單抗體(ti) 由Akoya提供,並已通過完整的CODEX抗體(ti) 驗證過程和製造質量控製。我們(men) 庫存的抗體(ti) 也得到了我們(men) 現場支持團隊的全麵支持。

 

 

CODEX抗體(ti) 已在多種類型的人類FFPE組織中進行了測試。這些CODEX抗體(ti) 與(yu) 不同的CODEX條形碼(BX000)結合。每個(ge) 試劑盒包含一管CODEX抗體(ti) 和一管相應的染料標記的Reporter(RX000),在標準染色條件下有足夠的容量用於(yu) 25 CODEX運行(或測試)。推薦用於(yu) FFPE組織的染料是Atto 550,Cy5和Alexa Fluor™750。

目錄 #

名稱

尺寸

4450036b-Catenin1-BX020(12F7)-Atto 550-RX02025項測試
4450030CD3e-BX045(EP449E)—Cy5-RX04525項測試
4350018CD4-BX003(EPR6855)—Cy5-RX00325項測試
4250012CD8-BX026(C8 / 144B)-Atto 550-RX02625項測試
4350020CD11c-BX024(118 / A5)—Cy5-RX02425項測試
4150018CD20-BX007(L26)— Alexa Fluor™488-RX00725項測試
4450018CD20-BX007(L26)— Alexa Fluor™750-RX00725項測試
4450027CD21-BX032(EP3093)—阿托550-RX03225項測試
4150017CD31-BX001(EP3095)— Alexa Fluor™488-RX00125項測試
4450017CD31-BX001(EP3095)— Alexa Fluor™750-RX00125項測試
4250002CD44-BX005(IM7)-阿托550-RX00525項測試
4250023CD45RO-BX017(UCHL1)-Atto 550-RX01725項測試
4350019CD68-BX015(KP1)—Cy5-RX01525項測試
4350001CD107a-BX006(H4A3)—Cy5-RX00625項測試
4250021E-cadherin-BX014(4A2C7)-Atto 550-RX01425項測試
4350021組蛋白H3磷酸酯(Ser28)-BX030(HTA28)-Cy5-RX03025項測試
4450029HLA-DR-BX033(EPR3692)—Cy5-RX03325項測試
4450031角蛋白14-BX002(聚19053)—阿托550-RX00225項測試
4250019Ki67-BX047(B56)-Atto 550-RX04725項測試
4450032LIF-BX006(M1506B09)—Cy5-RX00625項測試
4450034Mac2 / Galectin-3-BX035(M3 / 38)-Atto 550-RX03525項測試
4150020泛細胞角蛋白BX019(AE-1 / AE-3)-Alexa Fluor™488-RX01925項測試
4450020泛細胞角蛋白BX019(AE-1 / AE-3)-Alexa Fluor™750-RX01925項測試
4250004Podoplanin-BX023(NC-08)-Atto 550-RX02325項測試
4450033TFAM-BX029(18G102B2E11)-Atto 550-RX02925項測試

已經使用扁桃體(ti) 組織測試了用於(yu) 人類新鮮冷凍組織的CODEX抗體(ti) 。這些CODEX抗體(ti) 與(yu) 不同的CODEX條形碼(BX000)結合。每個(ge) 試劑盒包含一管CODEX抗體(ti) 和一管相應的染料標記的Reporter(RX000),在標準染色條件下有足夠的容量用於(yu) 25 CODEX運行(或測試)。推薦用於(yu) 人類新鮮冷凍組織的染料是Atto 550,Cy5和Alexa Fluor™488。

目錄#

名稱

尺寸

4250005CD2-BX002(RPA-2.10)-Atto 550-RX00225項測試
4350008CD3-BX015(UCHT1)—Cy5-RX01525項測試
4350010CD4-BX021(SK3)—Cy5-RX02125項測試
4150004CD8-BX004(SK1)—Alexa Fluor™488-RX00425項測試
4450004CD8-BX004(SK1)— Alexa Fluor™750-RX00425項測試
4350012CD11c-BX027(S-HCL-3)—Cy5-RX02725項測試
4350003CD19-BX003(HIB19)—Cy5-RX00325項測試
4150009CD21-BX013(Bu32)-Alexa Fluor™488-RX01325項測試
4450009CD21-BX013(Bu32)-Alexa Fluor™750-RX01325項測試
4250009CD31-BX032(WM59)—阿托550-RX03225項測試
4250020CD34-BX035(561)-阿托550-RX03525項測試
4150007CD38-BX007(HB-7)-Alexa Fluor™488-RX00725項測試
4450007CD38-BX007(HB-7)-Alexa Fluor™750-RX00725項測試
4150003CD45-BX001(HI30)— Alexa Fluor™488-RX00125項測試
4450003CD45-BX001(HI30)— Alexa Fluor™750-RX00125項測試
4250023CD45RO-BX017(UCHL1)-Atto 550-RX01725項測試
4350007CD49f-BX033(GoH3)—Cy5-RX03325項測試
4250022CD69-BX041(FN50)-阿托550-RX04125項測試
4150021CD90-BX022(5E10)-Alexa Fluor™488-RX02225項測試
4450021CD90-BX022(5E10)-Alexa Fluor™750-RX02225項測試
4250008CD104-BX005(58XB4)-Atto 550-RX00525項測試
4150008CD138-BX010(MI15)-Alexa Fluor™488-RX01025項測試
4450008CD138-BX010(MI15)— Alexa Fluor™750-RX01025項測試
4250013CD278-BX017(C398.4A)-Atto 550-RX01725項測試
4250010CD279-BX014(EH12.2H7)-Atto 550-RX01425項測試
4250006HLA-DR-BX026(L243)—阿托550-RX02625項測試
4250019Ki67-BX047(B56)-Atto 550-RX04725項測試
4150020泛細胞角蛋白BX019(AE-1 / AE-3)-Alexa Fluor™488-RX01925項測試
4450020泛細胞角蛋白BX019(AE-1 / AE-3)-Alexa Fluor™750-RX01925項測試
4250004Podoplanin-BX023(NC-08)-Atto 550-RX02325項測試

 

已使用脾髒組織測試了用於(yu) 小鼠新鮮冷凍組織的CODEX抗體(ti) 。這些CODEX抗體(ti) 與(yu) 不同的CODEX條形碼(BX000)結合。每個(ge) 試劑盒包含一管CODEX抗體(ti) 和一管相應的染料標記的Reporter(RX000),在標準染色條件下有足夠的容量用於(yu) 25 CODEX運行(或測試)。推薦用於(yu) 小鼠新鮮冷凍組織的染料是Atto 550,Cy5和Alexa Fluor™488。

目錄#

名稱

尺寸

4350014CD3-BX021(17A2)—Cy5-RX02125項測試
4250016CD4-BX026(RM4-5)—阿托550-RX02625項測試
4250007CD5-BX017(53-7.3)-Atto 550-RX01725項測試
4250017CD8a-BX029(53-6.7)-Atto 550-RX02925項測試
4150015CD11b-BX025(M1 / 70)—Alexa Fluor™488-RX02525項測試
4450015CD11b-BX025(M1 / 70)-Alexa Fluor™750-RX02525項測試
4350013CD11c-BX030(N418)—Cy5-RX03025項測試
4250014CD19-BX020(6D5)-Atto 550-RX02025項測試
4250015CD21 / 35-BX023(7E9)-Atto 550-RX02325項測試
4150014CD24-BX022(M1 / 69)—Alexa Fluor™488-RX02225項測試
4450014CD24-BX022(M1 / 69)-Alexa Fluor™750-RX02225項測試
4250001CD31-BX002(MEC13.3)-Atto 550-RX00225項測試
4150013CD38-BX019(90)— Alexa Fluor™488-RX01925項測試
4450013CD38-BX019(90)-Alexa Fluor™750-RX01925項測試
4250002CD44-BX005(IM7)-阿托550-RX00525項測試
4150002CD45-BX007(30-F11)— Alexa Fluor™488-RX00725項測試
4450002CD45-BX007(30-F11)— Alexa Fluor™750-RX00725項測試
4150006CD45R / B220-BX010(Ra3-6B2)-Alexa Fluor™488-RX01025項測試
4450006CD45R / B220-BX010(Ra3-6B2)-Alexa Fluor™750-RX01025項測試
4350007CD49f-BX033(GoH3)—Cy5-RX03325項測試
4350016CD71-BX027(RI7217)—Cy5-RX02725項測試
4450001CD90.2-BX001(30-H12)-Alexa Fluor™750-RX00125項測試
4150001CD90.2-BX001(30-H12)-Alexa Fluor™488-RX00125項測試
4350005CD169-BX015(3D6.112)—Cy5-RX01525項測試
4150012IgD-BX016(11-26c.2a)-Alexa Fluor™488-RX01625項測試
4450012IgD-BX016(11-26c.2a)-Alexa Fluor™750-RX01625項測試
4150011IgM-BX013(RMM-1)-Alexa Fluor™488-RX01325項測試
4450011IgM-BX013(RMM-1)-Alexa Fluor™750-RX01325項測試
4250019Ki67-BX047(B56)-Atto 550-RX04725項測試
4350015Ly6g-BX024(1A8)—Cy5-RX02425項測試
4250003MHC II-BX014(M5 / 114.15.2)-Atto 550-RX01425項測試
4350006TCRb-BX003(H57-597)—Cy5-RX00325項測試
4150005Ter119-BX004(TER-119)-Alexa Fluor™488-RX00425項測試
4450005Ter119-BX004(TER-119)-Alexa Fluor™750-RX00425項測試

CODEX ®屏蔽抗體(ti)

Akoya並未列出或提供CODEX篩選的抗體(ti) ,但包括一係列已純化並成功與(yu) CODEX Barcodes結合並在次級淋巴組織中顯示陽性染色信號的克隆。這些克隆可從(cong) 其他抗體(ti) 供應商處商購獲得,但需要終用戶偶聯。CODEX條形碼和相關(guan) 的共軛協議可通過Akoya獲得。

CODEX ®社區抗體(ti)

CODEX用戶群在不斷增長,我們(men) 鼓勵跨客戶站點的協作,以共享他們(men) 經過CODEX測試的克隆和協議的列表。這些CODEX社區抗體(ti) 雖然證明與(yu) CODEX儀(yi) 器兼容,但不會(hui) 通過Akoya出售。終用戶需要共軛。CODEX條形碼和相關(guan) 的共軛協議可通過Akoya獲得。我們(men) 正在繼續擴大名單。

 

CODEX ®抗體(ti) 的自定義(yi) 麵板設計

Akoya的CODEX係統為(wei) 用戶提供了靈活性,可以使用自定義(yi) 偶聯試劑盒創建由Akoya驗證的抗體(ti) 或標有CODEX Barcodes的克隆組成的麵板。用戶可以使用CODEX偶聯試劑盒和各個(ge) CODEX條形碼從(cong) 第三方抗體(ti) 供應商處穩健地製備克隆。

 

CODEX條碼

CODEX條形碼與(yu) CODEX偶聯試劑盒一起使用,可用於(yu) 定製抗體(ti) 麵板設計。每個(ge) 試劑盒均包含一管凍幹條形碼,用於(yu) 單個(ge) 結合反應;兩(liang) 管Reporters,用於(yu) 優(you) 化CODEX抗體(ti) 滴定和CODEX運行。對於(yu) 每個(ge) 條形碼,都有足夠的體(ti) 積用於(yu) 50 µg抗體(ti) 偶聯,根據產(chan) 量和滴度,可以提供足夠的材料用於(yu) 10至50個(ge) 染色。

 

 

 

 

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